【藥師琉璃光如來本願功德經药师赞】
十二大愿，饶益有情，密咒加持德难名，礼念愿圆成，怨业冰清，寿永福慧宏。
【药师赞】
药师佛延寿王，光临水月坛场，悲心救苦降吉祥，免难消灾障，忏悔众等三世罪，愿祈福寿绵长，吉星高照沐恩光，如意保安康。
【药师偈】
药师如来琉璃光，焰网庄严无等伦。
无边行愿利有情，各遂所求皆不退。
南无东方净琉璃世界药师琉璃光如来
南无药师琉璃光如来(数百千声)
南无日光遍照菩萨(三称)
南无月光遍照菩萨(三称)
南无药师会上佛菩萨 (三称)
【消解病咒】
唵 致哩多 致哩多 晖咤唎 娑婆诃 (七遍)
【赞十二药叉大将】
助佛宣扬，五色彩缕结其名，随愿悉圆成，冤业冰清，福寿永康宁。
【药师灌顶真言】(七遍)
nā mó bó qiéfá dì。pí shā shè。jù lǔ bì liú lí。
南谟薄伽伐帝。鞞杀社。窭噜薛琉璃。
bō lá pó。hé là shé yě。dá tuō jiē duō yē。
钵喇婆。喝啰阇也。怛他揭多也。
ā là hē dì。sān miǎo sān bó tuó yē。dá zhí tuō。
阿啰喝帝。三藐三勃陀耶。怛侄他。
ōng。pí shā shì。pí shā shì。pí shā shè。sān mó jiē dì。 suō hē。
唵。鞞杀逝。鞞杀逝。鞞杀社。三没揭帝。莎诃。
【药师心咒】(七遍)
喋(dié)雅(yǎ)他(tā)
嗡(wēng) 贝堪(kān)则贝堪则 玛哈贝堪则
喇杂萨(sà)目 嘎(gā)喋(dié)梭哈
南无药师法门历代传承诸大上师(三称及礼拜)
南无东方药师七佛(三称及礼拜)
顶礼东方无胜世界善称名吉祥王如来(三拜)
顶礼东方妙宝世界宝月智严光音自在王如来(三拜)
顶礼东方圆满香稷(jì)世界金色宝光妙行成就如来(三拜)
顶礼东方无忧世界无忧最胜吉祥如来(三拜)
顶礼东方法幢世界法海雷音如来(三拜)
顶礼东方善住宝海世界法海胜慧游戏神通如来(三拜)
顶礼东方净琉璃世界药师琉璃光如来(三拜)
南无本师释迦牟尼佛(三称及礼拜)
南无药师琉璃光如来本愿功德经(三称及礼拜)
南无药叉十二神将(三称及礼拜)
南无药师会上佛菩萨(三称及礼拜)
【补阙真言】
南谟喝啰怛那，哆啰夜耶。
佉啰佉啰。俱住俱住。
摩啰摩啰。虎啰，吽。贺贺，
苏怛拏，吽。泼抹拏，娑婆诃。(三遍)
【补阙圆满真言】
唵，呼嚧呼嚧，社曳穆契，娑诃。 (三遍)
【授三皈依】(皈依之人念)
愿弟子累生累世的历代宗亲眷属、冤亲债主、有缘众生：
皈依佛、皈依法、皈依僧;
皈依佛两足尊，皈依法离欲尊，皈依僧众中尊;
皈依佛不堕地狱，皈依法不堕饿鬼，皈依僧不堕旁生。(三遍)
皈依佛竟，皈依法竟，皈依僧竟。
从今以往，称佛为师，更不皈依邪魔外道;
从今以往，称法为师，更不皈依外道典籍;
从今以往，称僧为师，更不皈依外道邪众。(三遍)
南无阿弥陀佛。(三称及礼拜)
【回向】
愿以此功德 庄严佛净土
上报四重恩 下济三途苦
普愿见闻者 悉发菩提心
尽此一报身 同生极乐国
所修功德成遍知 调伏罪业众敌怨
生老病死波涛海 愿诸有情得解脱
文殊师利勇猛智 普贤慧行亦复然
随彼一切常修学 我今回向诸善根
愿消三障诸烦恼，愿得智慧真明了。
普愿罪障悉消除，世世常行菩萨道。
(普贤行愿品，有时间可以念)
所有十方世界中，三世一切人师子，我以清净身语意，一切遍礼尽无余。
普贤行愿威神力，普现一切如来前，一身复现刹尘身，一一遍礼刹尘佛。
于一尘中尘数佛，各处菩萨众会中，无尽法界尘亦然，深信诸佛皆充满。
各以一切音声海，普出无尽妙言辞，尽于未来一切劫，赞佛甚深功德海。
以诸最胜妙华鬘，伎乐涂香及伞盖，如是最胜庄严具，我以供养诸如来。
最胜衣服最胜香，末香烧香与灯烛，一一皆如妙高聚，我悉供养诸如来。
我以广大胜解心，深信一切三世佛，悉以普贤行愿力，普遍供养诸如来。
我昔所造诸恶业，皆由无始贪嗔痴，从身语意之所生，一切我今皆忏悔。
十方一切诸众生，二乘有学及无学，一切如来与菩萨，所有功德皆随喜。
十方所有世间灯，最初成就菩提者，我今一切皆劝请，转于无上妙法錀。
诸佛若欲示涅槃，我悉至诚而劝请，唯愿久住刹尘劫，利乐一切诸众生。
所有礼赞供养福，请佛住世转法錀，随喜忏悔诸善根，回向众生及佛道。
我将现在、过去所做的功徳，以及未来将要做的功徳，尤如十方诸佛菩萨和所有传承上师所做的功徳迴向一般，我也尽数将功徳迴向给六道一切如母有情众生。愿他们暂时得到人与天人的快乐和福报，种下善根，因缘福德具足，早日脱离轮回之苦，得到佛的果位。
我将此次诵经功德回向给我累生累世、累劫以来的历代宗亲眷属、冤亲债主、有缘众生，祈请南无药师琉璃光如来慈悲做主，超拨他们，令他们业障消除，离苦得乐，往生净土。弟子真心求忏悔。
