其实我们修行的药师经好处的非常多的，不但能够消除我们的业障，同时也是能够改变我们的命运让我们更好的去生活和修行。
第六大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，其身下劣、诸根不具、丑陋顽愚、盲聋喑哑、挛躄背偻、白癞癫狂，种种病苦;闻我名已，一切皆得端正黠慧，诸根完具，无诸疾苦。
第六大愿是药师佛十二大愿的中心。他说将来成佛时，一切众生身体下劣的，若能听到我的名号，便能得毫无缺陷的端正色身。下劣即身体是下等品质，像我也是，身体瘦瘦小小的不壮硕。什么样的色身不下劣?丈六金身，三十二相，八十种随形好，大概几千年才出一个--佛的相好庄严。等而下之，一切众生的身体都是下品。比下品还可怜的众生是诸根不具，这个世界充满了这种人。
我们这个世界的众生很可怜，色身多半下劣，诸根不具足，因此很丑陋。最庄严美丽的是佛，佛的相好庄严无等伦。其他凡夫众生能得相好庄严的也不是偶然，均有其果报。譬如以香花供佛的人，他生来世会得相好庄严的果报。此外，能把一个环境弄得干净清爽给别人使用，也等于是供养别人的香花，他生来世不会变丑陋之身。所以，能得‘相好庄严’那是积功累德修一切善法的结果。
丑陋是诸根不具之一种。以佛法看医生，丑陋就是病态，另外还有顽、愚、盲、聋、喑、哑、挛、躄、背、偻、白癞、癫狂……等种种病，都是很痛苦的病态。
顽：调皮捣蛋，冥顽不灵，妄作聪明，思想痴騃，没有智慧，怎么教都点不通，脑根不具足，愚：笨蛋，苯得不得了。盲：眼睛看不见。聋：耳朵听不着。喑哑：声音沙哑，喉咙有毛病。挛：是神经方面的毛病，全身痛，抽筋、抽痛等等，一天到晚都在这个果报中。躄：跛足，或半身不遂。背：弯腰驼背，背弯起来，腰干不直。偻：比驼背更严重，把腰弯起来了，现在比较少见，老一辈朋友中有。白癞：皮肤病。癫狂：精神病，心理病。
以上所说的病苦，大多就外形而言，人类的病痛有无数种，多得很。在座诸位都以为自己很健康，其实都在病中。
药师佛愿这些受苦折磨的人，在听到他的名号，一心虔诚诵修行药师如来法门，一切都能得到‘端正黠慧’，聪明有智慧，人身最难得的就是这四个字，形体端正，头脑聪明。有人聪明而不端正，有人端正却不聪明;既聪明又端正是修很多善行的福报而来。端正聪明已经不错，为何又加一句‘诸根完具’?因为诸根完具很难，很多人外表看起来很端正，但是，却有些暗病只有自己知道，绝对完全健康的几乎没有。
这一时代的众生果报，眼睛很坏，虽然没有瞎，却得靠玻璃生活;不袈上一副玻璃镜，对面不相识，这个滋味不好受。再加上这个时代物质文明的果报愈来愈好，众生果报却愈来愈差。依报是庄严，正报却完了;物质文明是依报，自己色身是正报。正报业力福报薄了，仰赖依报而活，很可怜!这叫作其身下劣。所以，药师佛怜悯后世一切众生，发愿成佛时，在他的佛光普照之下，一切众生没有生老病死苦。脱离生老病死苦是人类最不容易求得的，学佛修道的人都想跳出生老病死苦的圈子，但有几个人能真正跳出?这就要好好研究药师如来的道理了，尤其发心学佛修行，乃至发心学医，随时要修持药师如来法门。
以上就是药师经的一部分好处了，其实药师经的好处是无量的，只有我们自己去理解，才能够有更多的体会。
